Las Líneas de Generación y Aplicación de Conocimiento (LGAC) que se desarrollan en el CEFyMAP son actuales y dan sustento a la Maestría en Ciencias Físicas; en ellas participan los Profesores de Tiempo Completo (PTC) del área de Física, quienes cuentan con grado de doctorado y además colaboran con otros grupos de investigación de otras instituciones del país y del extranjero.

A continuación se describen las LGAC asociadas al programa, dando una reseña de las características de cada una de éstas, así como el nombre de los integrantes.